Apuntes y vídeos de Bioestadística

Apuntes y vídeos de Bioestadística de Francisco Javier Barón Lopez
En esta página dispone el material que F. J. Baron Lopez a preparado para los estudiantes de Bioestadística de la Universidad de Málaga. Esto incluye asignaturas de primer ciclo de la Licenciatura en Medicina, la Diplomatura en Fisioterapia, y asignaturas de tercer ciclo de algunos de los programas que se imparten en ambos centros.

Este material se distribuye libremente con la intención de que le pueda ser útil a cualquiera que quiera aprender o enseñar estadística. Si eres profesor, estás autorizado a modificar libremente los documentos para que se ajusten mejor a tus clases. Sólo está prohibido poner el simbolito “copyright” o algo con contenido semántico similar, en cualquier cosa que modifiques. Libre está cuando lo tomas y libre debe seguir después.

Como según parece por motivos legales a todo hay que darle algún tipo de licencia, lo que hay aquí esta bajo una

licencia de Creative Commons, que es la que parece menos restrictiva de las que he visto.

• Material para estudiantes de primer ciclo.
  Autoevaluación: Preguntas de test
• Material para estudiantes de doctorado.
• Anexo sobre bases de datos.
• Texto del libro
  Bioestadística: Métodos y Aplicaciones.

Apuntes de Bioestadística: Primer ciclo

Conforme vayamos avanzando en el curso, iréis encontrando nuevos temas.
Incluso puedo modificarlos completamente. Debéis estar atentos.

0 Práctica

Consistirán en trabajos a presentar en grupo.
El 15% de la evaluación del curso los obtendréis de la evaluación de estos.
Para ayudaros, adjuntos encontraréis una base de datos y una memoria.
Son datos reales cedidos por el Doctor Antonio Salazar de la Universidad Cardenal Herrera. El trabajo ganó un premio del instituto Médico Valenciano en 2002.
¡Ya sabéis el camino a seguir!

• 
  
  Vídeo en flash
  con la actividad a realizar (incompleto).
  Si quieres descargarlo a tu ordenador descomprime
  SPSS.zip

Texto del artículo de referencia, osteoporosis.pdf

Base de datos: (osteoporosis.sav – osteoporosis.csv)

1 Introducción a la estadística

Generalidades. Origen y objeto de la Bioestadística.
Estadística Descriptiva e Inferencial. Población y muestra.
Caracteres cualitativos y cuantitativos. Variables estadísticas.
Distribuciones estadísticas de un carácter. Frecuencias.
Tablas estadísticas. Representaciones gráficas.

• 
  Vídeo en flash.
  Si quieres descargarlo a tu ordenador descomprime tema1.zip

Apuntes:
estad_uma_01.pdf,
estad_uma_01.ppt

Práctica (uma_prac_01.wmv, 1.8MB):
Creación de una base de datos usando SPSS.
Recordaremos los conceptos de variables y tipos de variables.
Prepararemos una base de datos a partir de un formulario de encuesta.

2 Estadísticos

Cuantiles. Medidas de tendencia central. media aritmética, mediana y moda.
Conveniencias del uso de las distintas medidas centrales.
Medidas fundamentales de dispersión: varianza, desviación típica y
coeficiente de variación.
Asimetría. Curtosis.

 Apuntes:

 

estad_uma_02.pdf,estad_uma_02.ppt

Vídeo en flash.Si quieres descargarlo a tu ordenador descomprime tema2.zip

Práctica (uma_prac_02.wmv, 3.5MB):
Estadística descriptiva con una variable.
Tomaremos una base de datos de las que vienen con SPSS y aprenderemos a hacer tablas, representaciones gráficas y a calcular estadísticos que resuman la información.      

3 Estadística bivariante

Diagramas de dispersión.
Concepto de correlación. Concepto general de regresión.
Ajuste de una línea de regresión a un diagrama de dispersión.
Método de los mínimos cuadrados.
Bondad de un ajuste de regresión.

• 
  Vídeo en flash.
  Si quieres descargarlo a tu ordenador descomprime tema3.zip

Apuntes: estad_uma_03.pdf,

estad_uma_03.ppt

Práctica (uma_prac_03.wmv, 1.5MB):
Veremos cómo hacer un estudio de regresión lineal simple usando SPSS.

4 Introducción a la probabilidad

Sucesos. Probabilidad frecuentista y subjetiva. Probabilidad condicionada.
Teorema de la probalidad total. Teorema de Bayes. Riesgo relativo.
Pruebas diagnósticas.

• 
  Vídeo en flash.estad_uma_04.ppt

Práctica (1.6MB):Tablas de frecuencias de doble entrada.

Vuestro compañero Haim Benchimol, de primero de medicina, ha preparado un
script en flash que os ayudará a entender qué es la independencia entre sucesos.
En este caso se aprecia que no es independiente el que una persona tenga osteoporosis y su actividad laboral ¡Gracias Haim!

Si quieres descargarlo a tu ordenador descomprime tema4.zip

Apuntes: estad_uma_04.pdf,

5 Distribuciones de variables aleatorias.

Bernoulli. Binomial. Poisson. Normal y asociadas.

• Vídeo en flash Anexo sobre aproximación de la distribución binomial mediante distribuciones normales y de Poisson.
• Apuntes: estad_uma_05.pdf,estad_uma_05.ppt
  • Apuntes en varios formatos
    pdf - powerpoint )

6 Introducción a la inferencia estadística.

Muestreo. Distribución de estimadores. Teorema del límite central.
Estimación puntual. Estimación confidencial.

• 
  El siguiente vídeo embrolla, confunde aclara algunos conceptos de teoría de muestreo a partir de simulaciones
  estad_uma_06_simu.wmv, 11MB)
  • Apuntes en varios formatos
    ( pdf - powerpoint )

 

7 Contrastes de hipótesis.

Generalidades. Significación. Errores de tipo I y II.

• Vídeo de la teoría: estad_uma_07.wmv, 11MB.
  Aún no está pasado a formato flash. Ya veremos cuándo tengo tiempo de hacerlo.
  • Grabación de la clase: teo_doc_02.wmv
  • Apuntes: cap02.pdf
  • Simulaciónes: Mirad primero
    este vídeo alojado en google vídeo, y después, si os quedan ganas tenéis tiempo, este otro: estad_uma_06_simu.wmv, 11MB.
    Están tomado de los apuntes de primer ciclo y deberían aclarar algunos conceptos de teoría de muestreo a partir de simulaciones.
  • Grabación de la clase: teo_doc_03.wmv

Apuntes de Bioestadística: Tercer ciclo (doctorado)

Los apuntes en PDF deberíais leerlos antes de venir a clase
para un mejor aprovechamiento.
¡Son muchos temas y pocas horas!

1 Descriptiva

Breve repaso de conceptos de estadística descriptiva univariante y bivariante.

Grabación de la clase. El sonido no se registró bien. Se dividió el tema en tres partes:
teo_doc_01a.wmv, 34MB Conceptos básicos, tablas y gráficos univariantes.
teo_doc_01b.wmv, 45MB Estadísticos.
teo_doc_01c.wmv, 18MB Describiendo varias variables.
Apuntes: cap01.pdf
prac_doc_01.wmv

2 Intervalos de confianza

Grabación de la clase: teo_doc_02.wmv
Apuntes: cap02.pdf
Simulaciónes: Mirad primero este vídeo alojado en google vídeo, y después, si os quedan ganas tenéis tiempo, este otro: estad_uma_06_simu.wmv, 11MB. Están tomado de los apuntes de primer ciclo y deberían aclarar algunos conceptos de teoría de muestreo a partir de simulaciones.

 

3 Contrastes de hipótesis

 

• Apuntes: cap03.pdf
  1. Ficheros de datos en formato SPSS para practicar contrastes con una población, tstud.sav, y
     dos poblaciones, calcio.sav
  2. Vídeo de la práctica: prac_doc_04a.wmv, 1.7MBComparar dos medias obtenidas de grupos independientes.
  3. Vídeo de la práctica:  prac_doc_04b.wmv, 3MB. Comparar medias de observaciones apareadas.
  1. Base de datos en el formato de SPSS: lectura.sav en formato SPSS.
  2. Vídeo de la práctica: prac_doc_05.wmv, 3.9MB
     
  • Grabación de la clase:  teo_doc_04.wmv, 47MB
  • Apuntes: cap04.pdf
  • Prácticas
  • Grabación de la clase:  teo_doc_05.wmv, 31MB
  • Apuntes: cap05.pdf
  • Prácticas:
  • Grabación de la clase. Contiene la parte teórica y la práctica:
     

4 Variables numéricas en dos grupos

Pruebas apareadas y no apareadas de diferencia de medias: t-student, Wilcoxon, Mann-Whitney.

 
5 Variables numéricas en 3 o más Grupos

Pruebas ANOVA de un factor y de Kruskal-Wallis. Pruebas planeadas y no planeadas.

 
6 Regresión múltiple

Orientado a encontrar diferencias de medias, controlando el efecto de otras variables.

• Apuntes: cap06.pdf
• Base de datos en formato SPSS sobre la que se realiza la parte práctica: empleados.sav
  • No se grabó la clase teórica.
    Para la parte práctica, consultar la del siguiente tema (regresión logística), donde se hace alguna mención al hacer tablas de contingencia.
  • Apuntes: cap07.pdf
  • Grabación de la clase: teo_doc_08.wmv
  • Apuntes: cap08.pdf
  • Base de datos en formato SPSS sobre la que se realiza la parte práctica: penamuerte.sav

7 Contrastes de independencia Ji-cuadrado

Estudio de la asociación entre variables cualitativas.

8 Regresión logística

Orientado para estudiar factores de riesgo, controlando el efecto de otras variables.

 

• Vídeo de la práctica: prac_doc_08.wmv, 7.5MB          
  • Vídeo de prácticas para los estudiantes de primer ciclo. Se hace una base de datos muy simple con SPSS, uma_prac_01.wmv
  • Vídeo de la preparación de una base de datos relacional
    con MS access: prac_doc_bd.wmv

Bases de datos (anexo)

Esto no tiene nada que ver con las asignaturas que imparto, pero raro será que no necesitéis tener algún conocimiento de bases de datos para preparar un trabajo.
Como paso previo en todo estudio estadístico, debéis siempre construir una. Aquí os podéis hacer una idea de como preparar bases de datos simples con diferentes programas.

teo_doc_06.wmv, 17MB

 Vídeo en flash (incompleto) de la teoría.

• 
  
  Vídeo en flash Anexo sobre la distribución binomial.
• 
  
   Vídeo en flash Anexo sobre la distribución normal.

 

Google Video La distribución normal aparece de forma natural como
consecuencia de estimar medias a partir de muestras y usar el teorema del límite central.



Vídeo para móvil/PDA/MP4: descarga y pasa por bluetooth o USB a tu móvil el fichero
baron05-tcl.3gp, 4.1MB.

1 Descriptiva

Breve repaso de conceptos de estadística descriptiva univariante y bivariante.

• Grabación de la clase. El sonido no se registró bien.
  Se dividió el tema en tres partes:

1. teo_doc_01a.wmv, 34MB - Conceptos básicos, tablas y gráficos univariantes.
2. teo_doc_01b.wmv, 45MB – Estadísticos.
3. teo_doc_01c.wmv, 18MB – Describiendo varias variables.

Apuntes: cap01.pdf

Práctica:

Consultando Wikipedia encontramos tambien

• Distribución de Poisson
• Proceso de Poisson
• Regresión de Poisson
• Tablas de Contingencia

Fuente: http://www.bioestadistica.uma.es